清远市清城区人民医院成立于1988年9月，前身是1958年成立的清远县清城镇卫生院。医院坚持以创新发展为主题，以提升医疗卫生服务能力为主线，以专科建设为抓手，医疗技术力量显著增强，管理水平得到较大提升，发展成为清城区集临床、教学、科研、预防、保健、康复于一体的二级甲等综合医院。2008年以来，先后与广州医科大学附属第三医院、广州市正骨医院结为对口帮扶，与珠江医院建立普通外科、肝胆外科专科联盟。与中山大学孙逸仙纪念医院建立紧密型医联体，合作共建骨科、神经内科、心内科和甲乳外科等4个专科，柔性引进国家级人才唐亚梅教授、高梁斌教授。与广州医科大学附属第三医院建立专科联盟，合作共建消化内科、妇产科，柔性引进高层次人才李明松教授，建立消化内科“门诊-检查-住院”三位一体的规范化诊疗体系。与广州市正骨医院建立帮扶，引进“黄氏正骨疗法”技术。

2021年10月，清城区医改，成立医共体，加挂“清远市清城区医疗卫生共同体总医院”牌子。2022年12月，与中山大学附属孙逸仙纪念医院建立紧密型医联体，挂牌“中山大学孙逸仙纪念医院清远医疗中心”。2023年8月，清城区被省判定为县域医共体建设达到紧密型标准。

近年来医院荣获“清远市文明单位”、“清远市清城区创建卫生城市先进单位”、“清远市清城区创建文明城市先进单位”等荣誉称号。